Son muchísimos los parámetros que pueden afectar al cálculo de si un texto cabe o no cabe en la página y al final siempre necesita ajuste manual. En todas mis pruebas cabe el texto, pero algo se me debe de estar pasando.
De todas formas, edita el archivo plugins/plantillas_pdf/plantillas/ppdf_5.php, línea 286, y cámbiala por esta:
protected function set_totales(&$lineas, $coddivisa, $tb_options = ' cellpadding="1" cellspacing="2"', $margen = 10)
Esto aumenta el margen, a ver es suficiente.