Tal vez me equivoque, pero diría que por ahora no hay soporte para comisiones multi-nivel, sino que el empleado que hace la venta, es el que se lleva la comisión que tiene asignada en su ficha de empleado.
Entiendo que lo que propones, aunque no sea exactamente así, que va por este camino:
Tienes una jerarquía de niveles entre empleados, y estas comisiones se propagan hacia arriba. Hay el plugin de nóminas, que aunque no te sirva para esto, creo que si puede servir para que nos entendamos mejor. Te añade en el menú Nomina -> Organigrama, y desde ahí te muestra los niveles de los empleados y como tienen asignados sus cargos, en esta imagen es el resultado (aunque yo no lo he configurado, simplemente lo he instalado e ido a esa opción, con lo que no sabe los rangos y están todos al mismo nivel), tienes que hacer bastante zoom porque hay 251 empleados generados de forma aleatoria por el FSDK para tener datos de prueba.
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Así entiendo que una vez aplicada la jerarquía correctamente, lo que querrías es que dichas comisione se propaguen en esa misma jerarquía.
Si puedes, hazte una instalación de pruebas en tu equipo, y testea esta funcionalidad fuera del entorno de producción que estés utilizando.