Hola.
Que yo sepa no hay ningún plugin para personalizar la plantilla de factura detallada. Hay un plugin de venta que se llama
plantillas_pdf con multitud de plantillas que a lo mejor alguna se adapta a tus necesidades.
Si no tienes que modificar archivos del FS. El logo puedes posicionarlo modificando el archivo /plugins/factura_detallada/controller/factura_detallada.php en los valores de las líneas 218 y 219 del archivo.
Respecto a la forma de pago, tienes que modificar el archivo plugins/factura_detallada/fpdf17/fs_fpdf.php, la función addPago y allí jugar con los valores de $r1 y $y1 para desplazarlo allí donde te vaya mejor.
Mi consejo es que si vas a toquetear no lo hagas sobre la versión de trabajo. Por lo que pueda pasar. Y que si lo modificas, que te crees un plugin para conservar tus cambios independientes de las actualizaciones. (sobre esto hay vídeos fantásticos elaborados por Carlos).
Un cordial saludo