cual es el tamaño que recomendáis para el logo de...

Para los documentos simples no es problema el tamaño, sino las dimensiones. Los documentos simples están creados con una librería de PDF muy antigua y sin apenas opciones, así que al añadir un logotipo lo expande hasta ocupar todo el ancho. Modifica la imagen para añadir espacio a la derecha (o izquierda) y listo.

También pruebes usar el plugin plnatillas_pdf que está construido sobre una librería más moderna y tiene muchas más opciones. Este plugin ahora es de pago, pero en un futuro, cuando lo tenga amortizado, sustituirá a los documentos simples.