Hola, FacturaScripts 2018 todavía no está terminado, así que no es una opción. Saldrá una beta este mes, pero para pruebas, no para uso diario.
Si, se podrá actualizar de 2017 a 2018, como se ha hecho siempre, aunque en este caso serán más pasos ya que el cambio es más profundo.
Puedes ver más información en
la documentación de FacturaScripts 2018.
Saludos.