Buenas, alguien podría ayudarme en decirme como modifico...

Buenas, no se si lo habrás solucionado.
La única manera actual es modificar la función que lo controla. Entiendo que quieres esto que te paso en la imagen que muestra un numero de factura con ceros, en total quieres 8 números en total y la opción que utilizas es la que te mando también en la imagen..

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Esta es la opción que coges?

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Hay que modificar esta función y donde pone 12 debes poner 8, pero es una función del plugin de facturación base, así que se te va a modificar con las actualizaciones.. Te aconsejo que crees un plugin propio para este tipo de modificaciones y metes la función en él pero si quieres hacerlo directamente en la función, la puedes encontrar en
plugins/facturacion_base/functions.php y la función es function fs_documento_new_codigo($tipodoc, $codejercicio, $codserie, $numero, $sufijo = '')

Dentro de la función encontraras este código:

case '0-NUM':

                $codigo = str_pad($numero, 12, '0', STR_PAD_LEFT);

                break;

Tienes que cambiar 12 por 8

Saludos..

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